12月12日，据《南方都市报》报道，光明新区公明办事处党工委书记郭峰在发布会上称，着火点建筑确实属于临时建筑。根据已掌握情况来看，荣健农批市场是由上世纪八九十年代建的工业厂房，逐步进行产业转换而形成的。着火点建筑可能是 2008年前后搭建的。
至于该建筑有没有合法的建设手续，以及有没有办理工商税务等证照，郭峰称，工作人员正在调取相关资料。郭峰透露，涉及建筑物的报建、消防验收等问题是要重点调查的事实，会根据调查情况追究相关责任，并将相关情况向外界通报。
郭峰表示，按照规定作为“三合一”场所严禁住人，但实际上整治存在一定难度。仅去年一年该办事处拆掉违规隔层三十万平米，并且采取相应措施，但“前面清，后面又搬进来了”。荣健农批市场存在多次违法搭建的情况，今年以来该街道已经多次进行拆除整改，但时隔不久，乱搭建现象又返潮。此次起火的众多商铺中有四家住了人。
针对消防栓无水的质疑，深圳市消防支队参谋长张晓伟在发布会上称，现场救援中市场周围的消防栓有水，但存在压力不足的问题。深水光明水务有限公司有关负责人曾向媒体表示，由于光明新区成立较晚，城市化进程相对滞后，大部分消火栓年代久远，建设主体多样，施工标准不一，很多处于有人建设却无人维护管理的状态。而根据光明新区的要求，由深水光明负责公明办事处市政道路消防管网及消防栓的建设工作，市政消防栓则委托给深水光明管理。
12月12日，据《南方都市报》报道，记者获取的一份内部情况通报显示，陈泗珍所经营的A55号商铺被认定为起火地点。记者凌晨6时许在事发农批市场后方发现，有一处仓库窗户再次蹿出大火。消防人员急忙用高压水枪灭火，但因压力不够无法进行。随后仓库内的消防人员将火势控制住。深圳消防方面人士称，消防车驶离现场并不是离开，而是运水去了。对于此次火灾事故中消防栓的具体情况如何？为何现场附近的消防栓无法使用？深水光明水务有限公司拒绝了记者的采访要求。
12月12日，据《南方都市报》报道，“登记资料显示，荣健农副产品贸易有限公司项目需凭食品流通许可证以及建设项目环境影响审查批复两项，均已于今年10月9日过期，距今已经过期2个月，并未见补办。深圳市市场监督局食品安全局相关负责人表示，食品流通许可证过期未换，工商执照过期未年审的，依法都视为无照经营，都须依法处罚处理。”
12月12日16:34，@光明发布 称，光明新区迅速贯彻落实国务院、省、市领导有关“12•11”重大火灾事故批示指示及深圳市“12•11”重大火灾事故现场会精神，于12月12日上午在公明办事处紧急召开 “公明办事处根竹园火灾现场会”。以此次火灾事故为反面典型，现场开展警示教育，成立光明新区 “12.11”重大火灾事故处置领导小组，妥善处理善后事宜，迅速在全区范围内铺开“三合一”场所专项整治百日攻坚行动。
12月12日19:29，@光明发布 称，11日上午，在火灾紧急扑救中，经过多部门前期核查，初步确定 “12•11”重大火灾事故中16名死难者名单并对外公布。通过对逃生人员继续询问及多方核查，发现原事故死难者名单中陈利强实为陈绍威（男，出生于 2007年11月，广东五华人），公安部门特此进行更正，并对当事者表示歉意，对死难者表示沉痛哀悼。
12月12日19:40，@光明发布 称，事故发生后，公明办事处迅速成立善后工作领导小组和具体工作组，进行24小时善后处理；截至12日上午，已与全部死难者家属取得联系，组织4批家属前往殡仪馆辨认死者身份，安抚、接待死者家属、亲属123 人；组织医院等对事故中伤者进行24小时陪护。目前死者家属、伤者情绪稳定。
12月12日19:33，@深圳市场监管 称，2013年12 月12日《南方都市报》报道荣健农批“涉嫌无照经营”，经查：深圳市荣健农副产品贸易有限公司系有照经营 ，营业执照在有效期内，并已依法申报及通过年检。报道提及的“食品流通许可证过期未换”，经查：深圳市荣健农副产品贸易有限公司在取得营业执照和食品流通许可证后，仅开办和管理市场，未从事食品经营，因此在2013年10月19日原食品流通许可证过期卮，未再申请延期，也无须再办理食品流通许可证。水果等食用农产品经营按现行法律法规无须办理食品流通许可证。在该市场内，需办证的几十家经营户已办理了食品流通许可证，且在有效期内。