对于充值为何不能获得发票问题，深圳通公司回应称，因“深圳通”充值款在充值时不作为深圳通公司经营收入，充值款仅为预存款，据此不得提供发票。对于“深圳通”为何不能挂失问题，深圳通公司表示，深圳通要实行实名制才可能实现挂失功能。目前，深圳通除享受政府公交票价优惠补贴特殊人群（学生，残疾人等）为记名卡外，普通深圳通不记名卡，不挂失，属于电子钱包。至于“深圳通”卡为何不能实现实名制，深圳通公司回应称，如果深圳通卡全部实行实名制，由于公交设备属离线交易，挂失后生成黑名单数量巨大，不能满足公共交通领域快速通过，影响正常运营。鉴于以上原因，目前全国一卡通公司包括香港八达通都没有大量发行普通记名卡。
对于深圳通为何限制一人一卡问题，深圳通公司表示，根据深价联字[2007]51号《关于降低公交大巴票价的通知》第五条实行换乘优惠政策，在不同的公交线路及地铁间换乘，在刷卡优惠的基础上，给予0.4元/人次的换乘优惠。如果一卡多刷，则不能实现换乘优惠政策，所以深圳通卡只限于本人使用和享受优惠，一人一卡，不允许代人刷卡。
10月22日，深圳论坛网友发帖《深圳通公司化解“网友十问”于无形，请深圳通回答我问题》，对官方回应表示不满，并再次提出若干问题。
有关单位：市发改委、市交委、深圳通有限公司
计分情况（计量单位：分，单项满分：20）
当事人说
深圳通有限公司王总经理：小额消费是在2006、2007年开始的，早于中国人民银行制定的《非金融机构支付服务管理办法》，简单的说它违规是不恰当的。在我们理解，这个《办法》并不是针对公交一卡通企业，而是针对预付卡，如“一卡惠”等，后来发现最大的预付卡原来是公交一卡通，才把它纳入进来的。我们现在已经在积极申报，人民银行也十分支持，帮助我们整改。