6月17日，据《南方都市报》报道，市民间组织管理局委托亚太会计师事务所，对施惠零铅工程慈善基金会进行的专项审计中，爆出基金会存在捐了款没有办成积分入户可以退捐、使用假发票报账、超业务范围投资影视业等七大问题。目前市民间组织管理局已叫停该基金会，责令其整改。对于后续处理，该局表示将视基金会整改情况而定。 市人社局有关负责人称，他们是接社会举报，此后将相关问题移交给民政部门处理。
不过，市民间组织管理局于2014年1月发布的2012年度社会组织体检报告中，竟还认定该基金会基本合格。为什么人社局发现问题移交给主管的深圳市民政部门后，竟迟迟不予以处理。市民间组织管理局执法监督处相关负责人就表示，人社局并未将相关社会举报移交给该局，他们对此并不知情，直到近日接到社会举报后才展开调查。
6月17日，该基金会前员工前往市公安局经济犯罪侦查局报案称，基金会主要负责人存在侵占善款、洗钱的嫌疑。该局已受理该案。
6月17日，《信息时报》发表评论文章《慈善屡现丑闻，须问责监管部门》，认为“‘施惠零铅’把慈善运作成一门‘生意’，其操作过程中，还涉嫌编造美国前总统小布什题词来虚假宣传，涉嫌高价购置关联企业出售的慈善物资以完成利益输送……对于这些指控，民间组织管理局却采取了让人看不懂的轻微处罚，不但不及时开展调查，还为‘施惠零铅’自行整改留出了时间和空间。”
6月18日，据《南方都市报》报道，该举报人直指公益组织主管部门监管乏力，在面对举报后对于该基金会的处罚也是避重就轻。对此，记者联系市民间组织管理局进行咨询，截至发稿时未获得回应。
6月18日，都市频道“法观天下”栏目以《追问千万善款 举报人报案》为题关注事件进展。 6月18日，《新快报》发表评论文章《松绑社会组织,监管也要跟上来》，认为“既然民间组织的准入门槛已经放开,就不能重回单一的行政监管的老路,还得创新管理模式,要对民间慈善形成政府、捐助人、全社会的交叉管理,特别是通过专业会计师审计、律师尽职调查的监管,这些专业的监管不可能是便宜的。所以,在强调民间组织成立门槛在降低,‘一块钱’就能办的同时,不要忘了事后监管的艰巨:‘一块钱’办的民间组织,可能要花‘十块钱’来监管,关门时可能面临‘一百块’的责任。这种‘宽进严出’其实与公司登记改革的‘宽进严出’是一个道理。”
6月19日，据《南方都市报》报道， 市民管局回应称，该局知悉人社局的处理后，立即对该基金会相关负责人进行了训诫谈话，责令其立即停止违规操作，整顿财务制度，对于违规开具票据的捐款做出退款处理，并要求其对违规操作的工作人员做出处分。该基金会一共退还了199名捐赠者的捐款，共计60 .9万元。 与此同时，该局依法对该基金会2012年度开展活动情况进行了年度检查，给予该基金会2012年检基本合格，发出改正
意见书。鉴于该基金会整改情况达不到该局要求，2014年2月，该局对该基金会进行了立案调查，并委托深圳市亚太会计师事务所开展财务审计。经查，该基金会存在财务人员违规出具虚假的会计凭证、违反相关财务管理规定、存在内部交易行为、未依法变更登记、未按章程规定的业务范围开展活动等问题。 市民管局还表示，该局将进一步加大对社会组织的管理监察力度。
具体举措为，一是开展拉网式检查。从本月起，对全市社会组织进行不事先告知的抽查，重点对基金会进行拉网式检查。希望各媒体和社会各界及时举报社会组织的违法违规情况，该局发现一家，查处一家，决不姑息，对社会组织的违法违规行为实行“零容忍”。二是进一步完善社会组织综合监管机制，加强各部门间的信息共享，形成管理合力，及时发现和处理社会组织的违法违规行为，促进社会组织健康发展。三是完善基会管理的长效机制。基金会管理体制还不尽完善，该局将认真总结管理中存在的问题，积极完善相关管理制度和工作指引，进一步规范基金会管理，全面提升社会组织自身能力建设水平。
6月30日，据《深圳特区报》报道，市民政局局长杜鹏表示“施惠零铅基金会事件的确影响很不好。我们正配合公安机关对事件进行调查。在调查结果出来后，将依法依规严肃处理。这个事件也暴露出我们在基金会监管上存在的问题。近年来，深圳的社会组织以每年20%的速度在增长，如何将监管工作跟上？这将考验我们的智慧和能力。当前，市委市政府正在起草一个关于社会组织综合监管责任制的意见，以解决实行无主管直接登记后社会组织监管链条的缺失等问题，厘清政府各职能部门的监管责任。”
“同时，我们还要重点做两件事。第一，完善慈善信息公开制度，慈善组织的每一分钱从哪里来，怎么花出去，都能在网上显示得清清楚楚。同时建立诚信纪录档案，向社会公布，终生跟随，让人不敢违规。第二，我们要在近期对全市各基金会进行一次全面抽查，加强监督。我们希望通过对施惠零铅基金会事件举一反三，提高对包括基金会在内的慈善组织的管理水平，打造一个阳光透明的慈善环境，让每一分钱都在阳光下运行。”
有关单位：深圳市民政局、深圳市人力资源和社会保障局
事发地示意图
计分情况（计量单位：分，单项满分：20）
