光明科学城的总体布局分为科学技术领域布局和空间布局两部分——
科学技术领域布局。光明科学城重点发展信息、生命和新材料领域。
在信息领域，以缩小“摩尔定律时代”技术差距、加快培育自主创新生态为目标，重点发展集成电路、超级计算、网络通信、人工智能等细分领域，推进新一代信息技术突破应用、融合发展，形成安全可控、互相适配的信息技术创新体系。
在生命领域，聚焦生物产业创新发展需求，重点发展合成生物学、脑与认知科学、精准医学等细分领域，开展从微生物到灵长类再到人类生命的研究，形成全链条、全尺度的生命解析体系。
在新材料领域，适应材料研究从经验摸索到人工设计调控转变的趋势，重点发展贯穿制备、表征、计算和服役的全流程研发和应用，形成新材料发展创新体系。
空间布局。光明科学城规划面积约99平方公里，东、南至光明区边界，西至龙大高速、茅洲河，北至深莞边界。科学城构建“一心两区”的总体空间布局。
“一心”即光明中心区，以光明中心区为依托，建设科学城的生活服务中心。为科学城发展提供优质公共服务和特色性的科学服务设施。
“两区”即装置集聚区和产业转化区。装置集聚区集中布局重大科技基础设施、科研机构、前沿交叉研究平台、高水平大学等，并形成大科学装置集群、科教融合集群和科技创新集群“一主两副”的空间布局。产业转化区布局转移转化、孵化机构和创新创业服务机构，培育未来产业和新兴产业。
（光明科学城大科学装置布局示意图）
